Li todos os tópicos sobre esse problema, tenho um MBP 2012 e também tive problema depois que troquei meu hd radeon de 240gb por um Kingston A400 de 480gb, e começou a travar e ficar lento. Liquei no suporte da Apple e fizeram uma redefinição de distribuição de energia e a máquina virou outra.
Sinceramente ótimo suporte da apple, atencioso e competente, que fique registrado, pois na autorizada me falaram que eu tinha que trocar o cabo do hd que custa em meu estado 480 reais.
o procedimento é: Desligar a máquina completamente; pressionar Shtif+alt+command e o potão power por 10 segundos, depois soltar os botões e deixar ligar normalmente.
Espero que funcione para vocês como funcionou para mim.