A 9400 creio que deve rodar sem problemas os vídeos MKV.
Mas no PowerPC deve ser quase impossível rodar estes vídeos.
No caso do meu mac mini, o core2duo é o de 2.4...
Mas creio que até o de 2.26Ghz funcione de boa, porque a diferença em clock é muito pouca, não sei no resto dos quesitos, pois não avaliei a fundo.
Mas pra você ter uma noção tenho um notebook itautec L9310, com 2gb de ram, processador intel pentium su4100 dual core de 1.4, placa de video gma3000HD e roda de boa os vídeos em 1080p, porém sinto que flui muito melhor com a GeForce 320M e creio que também deve fluir muito melhor com a GeForce 9400M.