Olá, também sofri com isso.. O microfone interno funciona, mas ele pega muito ruído ambiente. As "soluções" que encontrei fuçando na internerd foram:
- headset usb (no mínimo 80 reais, e, ironicamente, da microsoft)
- interface usb de audio (http://www.griffintechnology.com/products/imic)
Acho ambas opções caras e burras, visto que inutiliza uma das poucas portas usb do macbook.
Pensei uns minutinhos, achei um earset bluetooth perdido aqui em casa, pareei com meu macbook e voilá! Posso falar no skype sem fios. Penso ser uma solução de custo/benefício bom pois este tipo de earset é bem barato, e tem a vantagem de não ter cabos.
Espero ter ajudado