O código do Pangu foi liberado e não há qualquer arquivo malicioso ou que possa causar dano ao aparelho, é seguro. A app store pirata que instalava na versão 1.0 era opcional, era só desmarcar o checkbox que aparecia na tela de início do Pangu que não era instalado nada. Aliás, na versão pro OS X (em inglês), o checkbox foi removido para não causar confusão nos usuários, então tá tudo ok com o software. Agora, se vale a pena fazer jailbreak ou não, quem decide é você se tem algo no jailbreak que lhe cause interesse. Dá umas pesquisas em alguns tweaks que você vai encontrar alguns interessantes.
Diego Strobelt deu reputação a Heitor em Fazer o Jailbreak ou não?