Seguinte, o problema descrito está relacionado a migração para o APFS. Pois na hora que feita a atualização há uma verificação da unidade de disco a ser instalada. Seja ela SSD ou HDD.
E quanto ao firmware todo novo sistema da Apple faz esse procedimento, não é a primeira a fazer isso, de upgrades no firmware do hardware. Qual é bem delicado pois em falhas pode vir ser bem prejudicial matado até o hardware em uma falha de energia ou algo do tipo.
Alguns erros relacionados ao update estão vinculados ao download com erros em sua imagem da instalação e migração do sistema anterior ao novo.
Solução:
Fazer backup do perfil completo do seu usuário, qual irá todos os seus dados contidos no macOS. Seja pelo Time Machine ou Carbon Copy Cloner.
Criar o pendrive de instalação do macOS High Sierra, para gerar uma instalação completamente limpa, assim evitado os erros acima descritos.
Pois todo processo de instalação durante o processo final da instalação voltar com seu backup do seu perfil de usuário assim tento seu macOS exatamente do jeito que estava antes sem perder nada.
Então por final terá seu Mac perfeitamente instalado.
Como o foco seus últimos sistemas a Apple vem aprimorando o macOS com foco de uso em hardware próprio. E ainda sim principalmente no novo sistemas de arquivos dela o APFS.
Agora quem irá aguarda alguma solução da mesma, irá esperar um tempinho pois é bem provável que soluções para atualização por cima do macOS anterior só seja liberada no macOS 10.13.1.
Tenho boa linha de hardware aqui como a maioria do que reportaram aqui, e todos apresentaram o mesmo sintoma. E visto nesses procedimentos todos estão no High Sierra funcionando tranquilamente agora.
Fábio_Muniz deu reputação a H4K0N3 em Problemas para instalar mac High Sierra