Quando comprei meu Macbook em 2011 também usei um e-mail pessoal (yahoo) que se tornou "ID Apple e endereço de e-mail principal" e o "Endereço de e-mail alternativo" é do iCloud. Quando acesso https://appleid.apple.com/account/home realmente não consigo mudar o ID Apple.
Sei que você já respondeu que não é possível, mas meu amigo na conta dele tem como ID Apple e endereço de e-mail principal o endereço do iCloud. E apenas isso. Sem vínculos com yahoo, gmail, hotmail, etc.