Opa, fala ai..
Então, se for um iPhone 6/ 6 Plus e vim com IOS 8.4.1 pra baixo, EU configuraria como um novo (Dependendo da versão do IOS que você já tem backup no iTunes ) e voltava apenas os contatos e notas ( O meu backup apenas do iCloud ) deixa a versão de sistema que vier de fábrica e só atualizava quando a IOS 9 estiver mais estável para o i6/ 6 Plus. Agora se for um 5s/5c/4s voltava o backup backup completo e já atualizava para a IOS 9 (Falo isso com base no que vejo no fórum, converso com amigos, quando uso o iPhone da minha namorada, entre outros.)